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在特定領域或情境中，展示產(chǎn)品、服務或解決方案如何被實際應用以解決具體問題的實例
隨著下一代測序(Next-generation sequencing，NGS)技術的發(fā)展與成熟，在科研、診斷、體檢各市場領域的應用范圍不斷擴大。如今，隨著市場不斷發(fā)展，測序技術自身開發(fā)速度卻逐漸放緩，樣品制備在NGS中的瓶頸效應越來越明顯，以縮短時間、提高通量為主要目標的新試劑、新儀器不斷涌現(xiàn)。同時，聚焦于樣本的更小處理體積的新方法也在不斷開發(fā)，但在NGS文庫構建的過程中，DNA片段化始終是一個無法避開的步驟。
▲NGS高通量測序基本流程Basicprocess for high-throughput sequencing NGS
對長鏈DNA(通常指生物染色體DNA)片段化的主要原因是短鏈DNA片段有利于進行DNA分子快速雜交和高靈敏目標檢測，可顯著提升測序效率。目前，常用的染色體脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid， DNA)分子片段化方法主要有四種，分別為：DNA限制性酶切法、水動力剪切法、超聲波斷裂法、噴射霧化法，四種方法各有利弊。
▲DNA分子結(jié)構形態(tài)Molecularstructure and morphology of DNA
超聲打斷基于水動力剪切法和超聲波斷裂法，是最常見的DNA片段化方式。其原理為：液體在高頻率的脈沖作用下，產(chǎn)生無數(shù)的高壓點和低壓點，伴隨產(chǎn)生的空化泡存在幾毫秒又因壓力變化而爆破，在這個過程中液體內(nèi)形成瞬時高強度剪切力，這種作用力可以破碎細胞、影響蛋白質(zhì)和剪切DNA。在此特別推薦新芝生物的一款特色產(chǎn)品：SCIENTZ18-A超聲波DNA打斷儀，采用非接觸式的工作方式，單次最高處理量可達12個樣品，是染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation，ChIP)和DNA剪切研究平臺的標準化工具。
產(chǎn)品優(yōu)勢
超聲波DNA打斷儀是將DNA暴露于均勻的超聲體系中進行無偏剪切，從而產(chǎn)生的大量均勻大小的雙鏈DNA，具有以下優(yōu)勢：
樣品零污染：非接觸式封閉破碎，降低污染風險
處理效率高：單次可處理12個樣品，處理速度快
無差別打斷：DNA片段集中無偏好
等溫處理：配備冷水機，恒溫打斷防止ChIP實驗中蛋白質(zhì)變性
使用流程
01.樣品前處理
使用高速分散器(例如XHF-DY)或研磨器(例如SCIENTZ-12或DY89-II)將生物樣品于冰浴條件(例如XB-70)下進行處理以獲得均質(zhì)溶液;
02.細胞破碎
對獲得的均質(zhì)溶液，一般使用超聲細胞破碎機(例如為SCIENTZ-IID)或高壓細胞破碎機(例如JG-IA)進行處理，特殊樣品可配置冰浴環(huán)境，以獲得含有細胞內(nèi)容物的溶液;
03.溶液離心
對細胞破碎后的溶液進行冷凍離心(例如HSC-2015L)，取上清液備用;
04.DNA打斷
4.1將破碎后溶液放置于0.2 mL或0.5 mL EP管，于適配器中旋緊螺母進行固定;
4.2將適配器置于水浴環(huán)境中，開啟配套冷水機，設置溫度為6℃;
4.3待溫度降至設定溫度時，設定DNA打斷參數(shù)(如超聲開20 s，超聲關25 s，功率300 W，超聲總時間30 min)，啟動打斷程序;
4.4完成打斷后，取下DNA樣品低溫保存防止降解，用于進一步研究。
應用案例
▲大腸桿菌DNA打斷效果
▲DNA濃度為50ng/uL的打斷效果
結(jié)語
SCIENTZ18-A超聲波DNA打斷儀采用恒溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合，具有無菌操作、無損作業(yè)、微量打斷的特點，同時處理多個樣品可完美適配二代測序，適用于多類生物樣品，是ChIP和DNA剪切研究平臺的重要工具。
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